الأعراض الشائعة لمرض كرون عديدة و تشمل:

آلام البطن.
الإسهال.
فقدان الوزن.
أمّا أقل الأعراض حدوثا و تشمل:

فقدان الشهية.
حمى .
ألم المستقيم.
أحيانا نزيف المستقيم.
أعراض مرض كرون تعتمد على الموقع و مدى و شدة الالتهاب, و هناك أنواع فرعية مختلفة لمرض كرون و لها أيضًا مجموعة من الأعراض تشمل:
التهاب القولون نتيجة الاصابه القولون بمرض كرون هو الالتهاب يقتصر على القولون, و تكون الأعراض الشائعة :

ألم البطن.
الإسهال الدموي.
الم في الشرج و النواسير و الخراجات شبه المستقيم يمكن أن تكون موجوده أيضًا.
التهاب الأمعاء نتيجة إصابة الأمعاء بداء كرون و يقتصر الالتهاب علي الأمعاء الدقيقة ( تنقسم الامعاء إلي ثلاثة الجزء الأول الصائم و الجزء الثاني الدقاق و الثلاث الثاني عشر ).
في حالة ان الالتهاب بالدقاق وحده و يشار إلى التهاب اللفائفي كرون, و تظهر هذه الأعراض :

ألم البطن
الإسهال
انسداد في الأمعاء الدقيقة .
- التهاب اللفائفي كرون الطرفية هو الالتهاب الذي يؤثر فقط على نهاية الأمعاء الدقيقة (محطة الدقاق), هو جزء من الأمعاء الدقيقة الأقرب إلى القولون.

و أعراضة تتمثل في :

ألم البطن.
الإسهال.
انسداد معوي الصغيرة.
التهاب القولون الأمعاء اللفائفي و التهاب القولون معًا، من حيث وصف الالتهاب يشمل كلا من الأمعاء الدقيقة و القولون, و في تلك الحالة الأعراض تكون أشد قسوة :
الإسهال الدموي.
آلام في البطن.
انسداد الامعاء الصغيرة .
التهاب اللفائفي كرون الطرفية و التهاب القولون هو أكثر الأنواع شيوعا من أنواع مرض كرون. (التهاب القولون التقرحي كثيرا ما ينطوي فقط التهاب المستقيم أو التهاب المستقيم و القولون السيني الموجود في النهاية البعيدة من القولون. و يسمى باسم التهاب المستقيم التقرحي و الشرج او باسم التهاب السيني إذا كانت الاصابة في قولون السيني .

نجد أن ثلث المرضى الذين يعانون من نوع واحد أو أكثر من مرض كرون نجد أن منطقة الشرج بها :
1. تورم أنسجة العضلة العاصرة الشرجية و العضلات الموجودة في نهاية القولون الذي يتحكم في التغوط.
2. تطور القرحة و الشقوق (قرح طويل) داخل العضلة العاصرة الشرجية, و يمكن لهذه القرحة و الشقوق أن تسبب في حدوث نزيف و ألم مع التغوط.
3. نمو سريع للناسور الشرجي بين فتحة الشرج أو المستقيم و الجلد المحيط بفتحة الشرج), و قد تؤدي للمخاطية و نزيف من فتحات النواسير على الجلد.
4. تطور خراجات شبه المستقيم (هي مجموعات من منطقة الشرج والمستقيم), يمكن خراجات شبه المستقيم تسبب الحمى, و الألم حول فتحة الشرج.